Очевидно вы используете не тот датум в настройках разбивки на листы. Дело в том, что стандартные датумы SK42, SK63, UTM являются параметрами трансформации координат в географические на эллипсоиде WGS84 и обратно. О чем, было сказано здесь. Вам же необходимо получить координаты номенклатурных рамок на эллипсоиде Красовского. Для этого следует использовать датумы Pulkovo-42 для карты в СК42 и Pulkovo-42(SK63) для карты в СК63. О чем, кстати, сказано в поясняющем сообщении в окошке разбивки на номенклатурные листы. Если у вас нет этих датумов в списке скачайте стандартный Datums.ini.
Зачем нужны остальные датумы в списке, если разбивка на номенклатурные листы всегда производится на эллипсоиде Красовского? Они могут пригодиться в экзотических случаях, когда, например, имеем карту в системе координат UTM и необходимо вставить разбивку на номенклатурные листы СК42 или СК63. В этом случае рамки трапеций будут сразу пересчитаны в систему координат карты.