При сохранении карты вставленный растр сохранится в ней. Если растр вставлен по ссылке, надо следить, чтобы он не потерялся 
При перемещении файла растра, как писал paul, надо редактировать и путь к нему в карте.
Подогнанный таким образом растр теперь ничего не стоит сориентировать. Для этого всего лишь надо пометить этот растр в карте (это объект из слоя изображения) открыть окно Правка>Свойства объекта, здесь нажать кнопку Установить опору. При этом координаты углов изображения будет переданы в список опорных точек (Растр>Ориентирование>Опора). Если ваш растр в TIF формате и был вставлен по ссылке, его нужно удалить из карты. Затем выполнить Растр>Ориентирование>Модель>Внешнее ориентирование, выбрать файл растра, Вид съемки указать Карта, начать ориентирование. В окне ориентирования зарегистрируйте 4 угла растра по-порядку, начиная с левого нижнего, по-часовой.
После ориентирования можно повторить команду Вставка>Растровое изображение, чтобы добавить этот растр в карту. Если все было сделано правильно изображение ляжет на свое место.