Заметил определенные странности.
При показе узлов некоторые объекты показываются без них.
При создании полигонов в автоматическом режиме (включена кнопка “Полигоны” на панели сбора) такие объекты пропускаются. Соответственно, получаются неправильные полигоны (например полигоны перекрываются).
Выяснил, что узлы не отображаются если в менеджере слоев толщина линии стоит 0.